明朝年间，朝廷屡贡不休，导致马贼猖獗为患，遭受马贼洗劫涂炭的民众无不提心吊胆惶惑不安。在没有朝廷出兵清剿的援助下，民间惟有以自己有限的能力与马贼对抗。但在灭绝人性的马贼面前，民间的抵抗显得无济于事，常常是马贼肆虐过的地方，尸横遍野血流成河。为救民众免遭马贼的涂炭，佛界、道界和江湖武林纷纷出手。这其间，天龙派高手赵龙夫妇在与马贼首领交手中，双双中毒，危在旦夕。
　　赵龙的妻子白凤中毒后，邪毒侵入胎体的婴儿。为保住马龙的骨肉，白凤顶着师叔的压力，承受着马贼邪毒的折磨，于七个月后生下一个男婴，取名无邪。生下男婴后，白凤的生命走到了尽头，赵龙在仓山掌门委派弟子周游送来的百花还魂药的救治下，暂时压制住毒性的发作。可怜周游孤儿命苦，师叔收留周游，让周游做了赵龙的弟子。
　　时光荏苒，寒暑易节，一晃十几年时间过去了。十几年间，无邪、周游和后来投奔龙虎门的小娟，在赵龙的教授下武功日进、身手不凡。但是，伴随武功一起长进的，各自的秉性和修行相去甚远。周游生性善良宽大仁厚，颇得赵龙和师叔公喜欢；无邪因身带马贼邪毒，暴扈阴毒张狂不羁。
　　在身体日渐衰微的情况下，赵龙将龙虎门掌门之位传授给了周游，激起了无邪的憎恨。当晚，无邪窃取龙虎门掌门人信物时被父亲发现。无邪利欲熏心，置父子亲情于不顾，出手将父亲打伤后带着小娟离开龙虎门。赵龙气血攻心含恨而亡。处理完师傅的后事，周游铭记师傅的嘱托，前去寻找无邪。
　　无邪没有坐上龙虎门掌门人的位子，发誓找到百年前被龙虎门一分为二散落江湖的天极剑。无邪找到天极剑，凭借天极剑挑战江湖武林。随后的十年间，无邪寻遍江湖武林，犯下累累血债。为挽救遭邪毒侵蚀至魔的无邪，周游闭关十年，苦行修炼，终于修成掌门大法。周游参透师叔公的指点和师傅临终前留下的龙虎秘笈，用水、木、金、火、土五行阵法，在付出牺牲自己的代价后，帮助无邪逼出邪毒，重返人形。五年后的一天，无邪重现龙虎门，将周游的灵位和天极剑交由龙虎门掌门人小娟后，从此消失于江湖。

　　女作家徐寻（李心洁）在处女小说获得空前成功后陷入创作困境。在创作新的定名为《鬼域》的小说时，她期望向读者呈现一个如幻似真的“诡异空间”，无奈反反复复几次构想出来的故事情节都差强人意，而昔日情人的再一次现身，更令她心绪纷乱，一怒之下，她删除了电脑里的《鬼域》初稿，却自此进入自己虚构出来的“鬼域”。
　　一番惊险之旅之后，徐寻在鬼域里遇见一小女孩（曾雅琪），得知鬼域意为“被遗弃的空间”，现实生活中人们所遗弃的一切（包括打掉的胎儿），都能在这里找到。在该女孩的帮助下，徐寻开始了更加恐怖的逃亡旅程，后来两人在鬼域老伯（刘兆铭）的指点下，朝鬼域的出口奔去，小女孩的身世之谜逐渐被揭开。

　　某集团会计张志恒（张家辉 饰）为肥威所惑做假账，令公司亏空一千多万。事后肥威外逃，志恒被商业调查科起诉入狱9个月，他的老板更因缺钱致使妻子病故。9个月的牢狱之灾让志恒受尽欺凌与耻辱，不过他也因此结识了千中高手陈十四（王晶 饰）。志恒为其赌技和千术所折服，遂拜其为师，陈十四业刚好需要拍档对付陷害他的龙王（张兆辉 饰），两人一拍即合。志恒天资聪慧，尽得十四真传。两人出狱后先是惩治了当年欺骗十四的女千手，之后将目标锁定在龙王身上。在此过程中，志恒偶然发现十四竟打算将自己当作代罪羔羊。
　　针对龙王的骗局旋即展开，骗与被骗，几无界限……

　　小白（蔣雅文飾）獲表姐介紹而成為配音員，因此結識了收音師克明（譚耀文飾）。克明與小白相處下來，互生情愫。小白的表哥阿庭（魏駿傑飾）暗戀小白，對小白關懷備至，可惜小白不領情。小白喜愛白色，克明欲錄下大自然中純白的聲音。

　　姚七星（方中信 饰）和抽水强（森美 饰）被指派对付绑匪杀人王，经过一番激烈的枪战，杀人王重伤不治。临死前，愤怒的杀人王放出话来，说做鬼也不会放过姚七星。姚七星的血液里流淌着特殊的基因，身为家中老七，他竟然得到了能够看到鬼魂的阴阳眼。
　　一次偶然中，姚七星看到了被杀人王所害的好友，好友告诉姚七星，杀人王将会在头七之日从阴曹地府回来找他报仇，这让姚七星感到十分害怕。上司Madam徐（梁敏仪 饰）派遣姚七星和抽水强前往七号差馆处理文件，在那里，姚七星遇见了灵异顾问喃呒炳（元华 饰），这位经验丰富的顾问成为了姚七星最后一根救命稻草。

　　1999年，澳门回归中国前。澳门司警马振成（杜汶泽饰）因惹上是非遭停职，警察生涯即将终结。马振成与伙计仍然夜蒲，盲打误撞遇上一名神秘少女张碧欣（梁洛施饰）。张碧欣随之跟着马振成回家，醉酒醒来的马振成以为自己与对方有了一夜情，再加上碧欣声称是他与初恋情人分手后生下的女儿，更加令马振成错愕不已。
　　碧欣因欠租数月以致无家可归，其心爱的狗狗伊莎贝拉亦被无良业主赶走，下落不明。身为父亲的马振成希望能弥补以往的责任，其后碧欣坚决要与马振成同住，令一向放浪的马振成生活顿起变化。
　　为求自保，马振成企图以身犯险令自己得以脱罪，他的好友杜Sir（黄秋生饰）亦屡劝无效。张碧欣欢欣鼓舞地准备与父亲落草，对着同校男生也难掩得意之色。然而渐渐地马振成从张碧欣身上，体会到什么是责任。

　　相传警方派驻了上千卧底深入黑帮，就等时机成熟把社团一网打尽。此时警方雄图大志，将潜伏已久终于爆发的行动命名为“百年孤寂”。洪兴社树大招风，社团里各个话事人开始草木皆兵。相反洪兴老大淡定自若，他的女人苏菲（秦海璐饰）替他周旋于各帮派期间，力稳局势。
　　然而洪兴社团的众人已经按捺不住躁动。人人自危的情势开始：分管不同领域的华超（吴镇宇饰）、黎继祥（曾志伟饰）、钟孝礼（张智霖饰）、游志标（陈小春饰）几人当中，有的已经被警方掌握了犯罪证据，有的正陷入一场恐慌，看不清身边谁人是卧底身份。警方铲除洪兴社团即日可待。

　　当了八年卧底探员的海生（张家辉饰）成功逮捕犯罪分子Dark哥（吴镇宇饰），心想到终于可以摆脱卧底生活，海生感到生活又恢复了光明。
　　可是，事情却不是海生想的那样美好。复职的颁奖仪式草草了事，同事对他投来的不是关切与欣赏，而是不信任的目光。警员阿龙（黄秋生饰）只是默默地安慰他。
　　卧底时期的女友与自己分手，陌生人开始跟踪自己，海生觉得自己警员的生活远比卧底更加痛苦。他回想起卧底时候Dark哥与他的往事，不由得动容，而此时，海生卧底时的朋友找到海生，原来想逃离卧底生涯，远非那么简单。

　　吴彦祖、连凯、尹子维、陈子聪成立了一个名叫Alive的乐团，准备在乐坛创出自己的一片天地。然而，他们在访谈中收获了前辈极为尖锐的真知灼见：张学友坦言，技术包装害了唱片业，很多资质差的歌手也在浑水摸鱼；黄贯中表示，踏实创作的人越来越少；谢霆锋直言，唱片公司并不尊重歌手的意见；卢巧音暗讽狗仔队总是无理取闹……总之，很多人都一针见血地指出了乐坛的症结所在。事实也证明alive乐队的成长之路荆棘密布，先是主打歌曲被盗，在网上免费下载，其次是媒体总是挖空心思找他们的绯闻炒作，第三是公司对他们的包装越来越一厢情愿，第四是学舞不精，彩排偷懒，演唱会忘词等糗事，显然这支乐队距离他们的梦想越来越远……
　　吴彦祖凭借此片拿下香港电影金像奖新晋导演奖。

　　1999年，澳门回归中国前。澳门司警马振成（杜汶泽饰）因惹上是非遭停职，警察生涯即将终结。马振成与伙计仍然夜蒲，盲打误撞遇上一名神秘少女张碧欣（梁洛施饰）。张碧欣随之跟着马振成回家，醉酒醒来的马振成以为自己与对方有了一夜情，再加上碧欣声称是他与初恋情人分手后生下的女儿，更加令马振成错愕不已。
　　碧欣因欠租数月以致无家可归，其心爱的狗狗伊莎贝拉亦被无良业主赶走，下落不明。身为父亲的马振成希望能弥补以往的责任，其后碧欣坚决要与马振成同住，令一向放浪的马振成生活顿起变化。
　　为求自保，马振成企图以身犯险令自己得以脱罪，他的好友杜Sir（黄秋生饰）亦屡劝无效。张碧欣欢欣鼓舞地准备与父亲落草，对着同校男生也难掩得意之色。然而渐渐地马振成从张碧欣身上，体会到什么是责任。

　　为了女儿，Rose（拉达•米契尔 饰）与女儿一起来到了一个奇怪的地方。
　　女儿常常梦游，Rose寻遍医生都无法把女儿的病治好，虽然灰心过但Rose还是不愿放弃医治女儿。女儿是她的命根，女儿梦游时总是说着一个名字，于是她丢下丈夫（肖恩•宾 饰），到了那个叫寂静岭的地方。
　　Rose以为在那里能找到治疗女儿疾病的答案，但这个地方却出乎了她当初所想象。祸不单行的是女儿在这时候奇怪地失踪了。这里不像一般的城镇，空气中弥漫着让人窒息的浓雾。在这里居住的人不多，却有很多奇怪的生物居住，Rose到处寻找女儿，却不得要领。而且更常常遇到令她意想不到的事情，从未接触过的事物。渐渐的，她了解了有关这个地方的历史，也得知了一个秘密……

　　澳门回归前三天，五位情深意重的杀手。杀手阿和(张家辉饰)与妻子阿静(何超仪饰)带着刚满一个月的孩子重返故地，阿火(黄秋生饰)与阿波(林雪饰)奉黑社会老大大飞(任达华饰)的命令来追杀阿和，但另一对好兄弟阿泰(吴镇宇饰)与阿猫(张耀扬饰)闻讯，为了情义前来阻止。冲突在阿和家突然爆发，又迅速重归平静。最后他们决定一起做一宗大买卖来解救阿和，在谢夫(张兆辉饰)那里，摆放在他们眼前的是两个选择：暗杀蛋卷强(林家栋饰)或者抢夺一吨黄金……最终他们选择了前者，然而却在餐厅和死对头大飞不期而遇，一场恶战难免。

　　总督察刘正熙（梁朝伟饰）与妻子金淑珍（徐静蕾饰）过着甜蜜生活。与刘正熙本是同事兼好友的丘建邦（金城武饰），被革去警察职务后当起了私家侦探，终日喝酒至烂醉如泥，因多年前女友自杀身亡令他久久不能忘怀，与卖酒女细凤（舒淇饰）的关系扑朔迷离。金淑珍的父亲，富豪金元胜突然被杀害，矛头直指两个无业游民，可是嫌疑人也在案发的一个星期后被杀害，警方也迅速结案。
　　但金淑珍觉得案中疑点重重，就拜托丘建邦帮忙。随着案件的逐步抽丝剥茧，发现了意想不到的秘密，以及故意纵火企图杀死金淑珍的元凶。
　　一个伤心的城市，到底隐藏了多少秘密在其中呢？

　　向西望（葛民辉 饰）经营着一间皮肤病诊所，专为因寻花问柳而不幸染病的男士们提供治疗。向西望以其精湛的技术和热情的服务赢得了众多客户的亲睐，将诊所运营得风生水起，再加上一个妖娆多姿的女助手马晓阳（卢巧音 饰），两人之间的配合天衣无缝，如虎添翼。
　　王菲菲（李茏怡 饰）是娱乐圈里冉冉升起的新星，一次偶然中，她在会所结识了名为陶兵（梁俊一 饰）的按摩师，两人一见钟情，很快坠入情网不能自拔。然而，这将注定是一段没有结果的感情，因为王菲菲和陶兵都各有恋人，尽管感情已经随着时间的流逝而逐渐淡漠，但两人想要走到一起，中间阻隔的，却并不只是千山万水这么简单。

　　女拳击手小柔（樊亦敏 饰）、云妮（张慧仪 饰）、唐仪（彭丹 饰）为同门师姐妹，三人不仅功夫了得，更长得美艳如花、火辣丰满，被称为拳坛三艳花。云妮被黑社会龙头安皇（姜皓文 饰）陷害，擂台上当场被打至残废。小柔气愤不过决心为云妮报仇，以自创的“舞武功”把对手活活打至吐血重伤，成功雪恨。却因此惹怒了心狠手辣的安皇，多次派手下对付小柔等人，并拿出自己的王牌——唐仪，公开向小柔发出生死文书，昔日同门无法避免一场残酷的血战……