冷静理智的法政部高级化验师高彦博（欧阳震华 饰），洞察力过人的他单凭一条头发、衣物纤维便能协助警方破案。但他没有想到的是，妻子的弟弟、身为法医的古泽琛（林文龙 饰）和高级督察梁小柔（蒙嘉慧 饰），都怀疑彦博毒害了自己的妻子。
　　彦博只好用自己的学习的专业知识证明自己的清白。后来彦博、泽琛、小柔三人都成为了各自领域的精英，一起携手合作揭破了一宗又一宗迷离案件，但谜团还是不断出现，甚至威胁到了他们的生命危险……

　　施世纶（欧阳震华 饰）幼时曾遭遇意外，无端失踪三天后再度出现时竟对那三日的经历全部遗忘，还摔断了左手，思维也不如从前灵活。其母因此内疚不已，万事都替儿子安排妥当，待到施世纶成年时就捐了一任县令给儿子来当。在师爷的协助下，施世纶的官当得有声有色，不久又带着母亲和三位夫人到江都县任县官。一次，施世纶在荒郊野岭遭遇意外并昏迷，梦中有一个仙枕，还有一老头与施世纶争抢。这并非一般的梦，梦境亦幻亦真竟能为施世纶在现实生活中破案时指点迷津……在江都，施世纶还邂逅了蓉（郭可盈 饰），两人起初是一对冤家，却在逐渐了解的过程中互生情愫……

　　这日，飞鱼山庄弟子叶梦色（杨怡 饰）和宋晚灯（郭耀明 饰）马不停蹄的赶到聚贤镇去阻止黑白两道的仇杀，因为黑白两道每五年一次的金印之战在即，他们闻识黑道将派人刺杀白道参战的高手。岂料他们刚到那里，黄山派高手丘断刀就被人击杀，令人意外的是，求死大师却自认是杀人凶手。求死大师的好友神相李布衣（林文龙 饰）为了调查真相，还好友一个清白，于是着手调查这宗悬案。布衣发现了一位行踪神秘的蒙面人，还得知他曾打听雁荡派高手秦燕横的下落，心感不妙的布衣马上跟踪蒙面人。布衣跟总蒙面人来到戏院，发现了在场的秦燕横，布衣为了阻止秦燕横被杀，和蒙面人大打出手，不料这时一阵狂风吹过，秦燕横竟然心脏破裂而死！随后，布衣在秦燕横身上发现了医神的一线针，令事件越发迷离！

　　户部郎中齐学仁为官刚正不阿、一直不肯同流合污，幕后黑手连同他的上司户部侍郎柴毅一起栽赃嫁祸，令到银库里巨额白银不已而非，齐家一家被收监问斩。幸好义仆舍身从监房里换出了学仁的儿子齐百川（陈豪 饰），齐家才保留了一点血脉。目睹了家人和义仆被当众抄斩，百川悲愤不已。随后他流落街头、万念俱灰，一次偶然机会被当地最大的票号鼎丰盛东主乔本业（姜大卫 饰）看中，招入了鼎丰盛当学徒。进入鼎丰盛让百川看到了一个彻查全家被斩的冤案的机会，他化名子齐，一方面努力学习票号业务，一方面努力往上爬，为的就是有朝一日能借助鼎丰盛为全家翻案。另一方面，票号的大掌柜曹裕泰（刘丹 饰）一直想当上鼎丰盛的东主，连合鼎丰盛全国各分号的老帮逼宫，后被乔本业化解危机，不甘心的曹裕泰离开了鼎丰盛另立炉灶对抗鼎丰盛。乔本业一次偶然救了来自塞外的巴巴哈儿高娃（郭羡妮 饰）姐弟，两人随后也留在了鼎丰盛工作。子齐与高娃在朝夕相处中互生爱慕，但身负复仇使命的子齐知道自己可能会连累高娃，于是选择了独自承担……

　　米亚高公司总裁高卓文准备在新产品发布会上，宣布独子高峰（郭晋安饰）接手公司事务。峰在会前向女友兼产品代言人乐佩佩提出分手，谁知佩佩在穿上红旗袍，在台上自称林敏，疯言疯语。峰发现佩佩的话语是六十年代自杀女性林敏遗作中的对白。峰的好友警察钟智坚正调查的女子自杀案，死者死前亦自称林敏。调查中认为新助理司徒珊（伍咏薇饰）十分可疑，遂调查她的身世，发现她母亲有精神病史，亦爱扮演林敏，最后自杀而亡。
　　高卓文在家中被杀害，但家中每个人都有不在场的证据。律师宣读遗嘱时，峰竟一无所得，而最大的得益者是司徒珊。峰失去父亲又遭受家庭突变，离开香港去调查真相。司徒珊原来是高卓文的亲生女儿，峰的身世顿时扑朔迷离，他的母亲是谁？生父是谁？这个谜一样的家庭里，还埋藏着多少不为人知的秘密？

　　故事发生在明朝，失忆的风行烈（林峰 饰）并不知道自己是蒙古国王子，追求逍遥自由的本性表露无遗，更为了博取靳冰云（郭羡妮 饰）红颜一笑，决定夺取武林宝剑覆雨剑，因而与韩柏（黄宗泽 饰）不打不相识，更结交成为好友。那边夺回的覆雨剑却被冰云送给大魔头庞班（郭政鸿 饰），风行烈始料未及。原来冰云一心所钟情的是庞班，为了爱人不惜出卖风行烈，累及风行烈失去所有武功还被追杀，幸得韩柏相救。此时韩柏士别三日当刮目相看，已得到赤尊信传授毕生功力成为武林高手。
　　庞班所作的一切其实是为了辅佐风行烈复国，而复国最大的阻碍来自韩柏。要发挥覆雨剑最大的功效，就必须要练成“剑心通明”，江湖上能与风行烈共练此剑的，唯有慈航静斋大弟子秦梦瑶（佘诗曼 饰），然而身为大明的支柱，秦梦瑶立场坚定。风行烈唯有用情来打动她。而明室之中，亦有内奸，最有才能的燕王朱棣面对天命及冤屈，亦要做出重大的选择。