1942年，冀中的抗战形势艰苦卓绝、生死攸关。为粉碎侵华日军华北驻屯军司令官冈村宁次上将发动的“五一大扫荡”，冀中军区司令员吕正操和冀中区党委负责同志研究决定，主力部队由内线向外线转移，冀中区党政军机关人员进行大规模精减，精简人员分散隐蔽到可靠的村庄，和群众一起坚持反扫荡。在精简下来的人员中，时任冀中区妇救会宣传部长的吕正操的妻子刘沙，因身怀有孕，被安排留了下来。
　　分手在即，吕正操和妻子依依惜别。为迷惑敌人，吕正操决定在冀中军区大张旗鼓地召开 “五一”庆祝大会，造成我主力部队和首脑机关已被日军包围的假象。庆祝大会的当晚，吕正操率冀中区领导机关反扫荡队伍，趁着雨夜，跟日军走了个擦肩而过，跨过沧石路，淌过滏阳河，顺利跳出了日军的包围圈。鬼子在第一个回合中扑了空，遂变换手法，却被吕正操识破，在一场鬼子的互战中损失惨重。
　　不久，刘沙在根据地妇女主任照料下顺利生下一个男孩。此时，反扫荡斗争取得局部胜利，极大地挫败了日军的威风，但也助长了我军少数指战员轻敌的思想。关键时刻，吕正操对敌我形势有着清醒地分析和认识，果断作出决定，以区党委和军区的名义，向所属五个军分区发布命令，催促他们迅速向外线转移，且不可贪功恋战。然而，部队在连续的胜利中还是存在贪功恋战的现象，并为此付出惨痛的代价。
　　据可靠情报，日军有重点合击河间、肃宁、饶阳、献县边界地区的迹象，八分区司令员常德善主张当夜跳出包围圈，转移到子牙河东去。对与常德善的正确决定，王远音政委持反对意见，并行使“政委最后决定权”，结果导致千余人的队伍全军覆没，司令员和政委也双双牺牲。爱将常德善的牺牲，使吕正操认识到战场打仗“政委最后决定权”的弊端，建议中央军委和毛主席从此撤消这一制度。
　　经过艰苦卓绝的迂回周旋，吕正操率领冀中军区主力部队及党政军首脑机关跳出敌人的合击圈，彻底粉碎了日寇 “五一大扫荡”的图谋。反扫荡结束后，刘沙在警卫员小胜的保护下，历尽艰险，带着孩子来到吕正操身边。在战士们的祝贺中，取得反扫荡胜利和“革命从此后继有人”的喜悦，在吕正操的脸上荡漾开来。

　　故事以一个由我抗联战士组成的全部苏军编制及装备的精锐小分队屡次越境回国，在日寇占领下的东北敌后执行各项侦察任务为主线，用10个故事表现了从雅尔塔会议到二战的最后一役——１９４５年８月３０日结束的东宁要塞之役的全过程。这支中国旅在军事史料中是一支闻名整个苏军的奇兵，屡建奇功，令敌人闻风丧胆。剧集中除了人名等有所改变，基本的战役和背景都具有历史的真实性。据腾有为介绍，《远东特遣对》是一部标准的男人戏，场面宏大，背景波澜壮阔，战斗场面激烈。穿著军装的红粉佳人在其中戏分很少，仅是点缀。这一点和同样表现二战故事但缺少浪漫情调的《兄弟连》有异曲同工之处。

　　1937年日军全面侵华后，华北危急。国共合作的背景下，红军改编为八路军，在总司令朱德（王伍福 饰）率领下东渡黄河奔赴前线抗战。山西实权人物阎锡山面对“国、共、日”三股力量颇为头疼，提出“守土抗日”口号，在民族大义的影响下，于形式上支持八路军抗日。朱德筹划于日军进犯山西的必经险地平型关截击，115师师长林彪临战指挥出色，成功击败板垣师团，史称“平型关大捷”。同时八路军用灵活的战术亦减轻了国军战场的压力。不久日军以优势兵力、装备围攻太原一线，蒋、阎战略判断失误，正面战场接连失败，八路军转入敌后根据地建设，自此拉开了军民抗击日寇的伟大事业……